Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный парк "Сайлюгемский" образовано в соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 27 декабря 2012 года № 2545-р и находится в ведении Минприроды России.

Свою деятельность учреждение начало 20 августа 2013 года.

Основными целями деятельности организации являются сохранение и восстановление уникальных и типичных природных комплексов и объектов, расположенных на территории национального парка "Сайлюгемский", экологическое просвещение населения, разработка и внедрение научных методов охраны природы, осуществление экологического мониторинга, а также создание условий для регулируемого туризма и отдыха.